Aktivne materije koje se nalaze u njihovom sastavu mogu vremenom da stvore rezistentnost na antibiotike, kao i da naruše dejstvo hormona u organizmu. U nekoliko narednih godina, proizvođači će morati da dokažu korist ovih sredstava za čišćenje, ili da ih uklone s rafova u prodavnicama. Do tada, korisnici treba da izbjegavaju upotrebu antibakterijskih sapuna.

Dok se zvanično ne povuku s tržišta sredstva koja sadrže triklosan i triklocarbon (hemijske materije koje se tipično koriste u pesticidima), medicinski sručnjaci savjetuju izbjegavanje svih proizvoda koji su označeni kao antibakterijski, antiseptični ili antimikrobni.

Jedini izuzetak su alkoholna sredstva za čišćenje ruku, jer ne predstavljaju isti rizik za zdravlje. Običan sapun i voda su i dalje najbolji i najsigurniji za upotrebu.